正己酸在食品、醫(yī)藥，以及化學(xué)工業(yè)中用途廣泛。例如有正己酸和乙醇合成的正己酸乙酯是勾兌酒類(lèi)的香精之一，與甘油合成的三己酸甘油酯是人造奶油和牛奶加工過(guò)程中的主要食品添加劑。檀香木油（sandalwood oil）和己酸生成的酯具有持久的香味，用于香料和香水的生產(chǎn)。此外正己酸還是合成避孕藥和癬藥，抗癌藥己雷瑣辛等的主要原料。己酸做為表面活性劑生產(chǎn)中的添加劑，可使產(chǎn)品成均勻，且澄清、透明。
